全自動微生物基因指紋鑒定系統RiboPrinter? System

高準確度、高分辨力的微生物鑒定和分子分型

基于您需求和優越體驗的產品設計

RiboPrinter® System 全自動微生物基因指紋鑒定系統以微生物獨特的基因組為基礎，可自動化同步完成菌株水平的鑒定和分子分型，實現產品、環境、設備、人員等全方位的微生物風險預警和污染溯源。該系統擁有10多項專利技術，基本原理為限制性內切酶長度多態性分析（RFLP）和分子印跡雜交（Southern Blot）分析，可進行但不局限于核糖體分型（Ribotyping）及其拓展應用，更可開展個性化的酶切、電泳和探針雜交研究，滿足多種用途的應用需求。

該系統集成了RFLP，凝膠電泳，Southern Blot，標準菌株基因指紋圖譜數據庫和自動化生物信息學分析五大系統，是全球唯一的全自動、標準化微生物鑒定分型工作站，是進行快速、準確、高分辨力微生物菌株水平鑒定和分子分型的有力工具。

屢獲大獎的RiboPrinter® 系統為食品、制藥、第三方檢測、政府監管技術部門的用戶提供了一種快速簡便，同時又非常準確和標準化的食品、藥品和環境樣品的檢測手段。

·8小時菌株水平核酸鑒定+分子分型同步完成

·全自動、高度標準化流程，手工操作僅一步

·大容量專家數據庫，經權威驗證的8528條標準菌株信息

·未知微生物直接上機檢測和分析，無需預實驗

·支持多種限制性酶切及探針組合應用，可擴展的微生物鑒定分型應用平臺及服務

·出眾的廣譜分析和高分辨分型及溯源能力

·全自動生物信息學分析和數據管理

·交互式聯網架構，快速構建監測網絡和預警溯源平臺

·應用領域廣泛

 ·微生物相關學科基礎研究

 ·食品、制藥、個人護理用品安全

 ·人和動物的疾病預防與控制

 ·公共衛生及微生物風險評估與監測

產品特點

RiboPrinter® 系統可快速分析微生物的全基因組DNA，8小時內同步完成菌株水平的核酸鑒定和分子分型，具有高準確度、高分辨力、廣譜檢測、快速簡便和標準化的特點，是常規檢測、風險評估和管理以及公共衛生突發事件快速反應的首選方法，也是美國藥典 USP 推薦之微生物鑒定、分型和溯源技術。

擁有10多項專利技術，集成了DNA酶切、電泳、印跡、分子雜交、成像、標準菌株數據庫和自動化生物信息學分析7大模塊，是全球唯一的全自動、標準化微生物鑒定和分型工作站。

RiboPrinter® 系統的含金量超出常規鑒定或分型設備的范疇：

·高準確度，基于微生物基因型特征檢測，比傳統法表型方法更可靠

·8小時菌株水平的核酸鑒定+分子分型同步完成

·全自動標準化流程，手工步驟僅一步，無需復雜的分子生物學操作，對人員的資質和培訓要求低，可最大程度避免人為干擾和交叉污染風險

·高分辨力，兼具廣譜分析和特定目標菌的高分辨分型能力

·原位酶切，高保真還原菌株的全基因組信息

·高通量，8h工作時間可連續檢測32個樣品

·通用標準化試劑盒實現廣譜檢測需求，無需預實驗即可開展鑒定和分型，同時方便試劑采購和應急儲備，避免過期造成浪費

·未知菌株直接上機，無需知曉種屬信息即可開展分析

·支持多種限制性酶切及個性化探針應用，滿足您的高級應用需求

·大容量數據庫含8528條標準菌株信息，全部經國際三大菌種保藏中心ATCC，JCM和DSMZ驗證，數據沒有盲點和模糊點，并持續更新

·成像模塊和分析軟件可自動將實際指紋圖像數字化，自動進行條帶位移測算、分子量測算和濃度測算，優化算法并輸出指紋圖譜及峰型圖，結果信息豐富，滿足回顧性和預測性分析所需

·專家級數據庫和優化算法確保了鑒定和分型結果的準確性，生物信息學分析功能可自動給出菌株比對、鑒定和相似性結果，并自動聚類分析，根據您的需求分成不同型別，完全避免主觀因素，實現高分辨的菌株溯源

·兼容的電子數據，方便存儲、分享和恢復，并可與第三方數據分析軟件（如BioNumerics）對接，實現不同平臺的數據比對和分析

·交互式聯網架構，獨特的“一對一”，“一對多”和“多對一”數據系統架構，助您快速構建監測網絡和預警溯源平臺。還可實現設備的遠程訪問、操作和診斷，即使身處辦公室亦可實時分析數據、監控實驗狀態和進展

菌株水平上的微生物鑒定和分子分型

RiboPrinter® 系統可對菌株進行全基因組分析，在菌株水平上實現鑒定和分子分型同步完成。其工作主要可分為三大步：全基因組酶切，DNA片段分離和特異探針雜交目標序列，全自動化的數據處理及生物信息學分析。

全基因組酶切

限制性內切酶可對細菌全基因組進行酶切，產生大量DNA片段。由于菌株之間存在同源性和變異性，酶切不同種屬或不同株的基因組時，酶切產物中就會存在相同或不同長度的DNA片段，通過特異探針雜交可解讀目標DNA片段在分子水平上的差異。

電泳、Southern印跡、探針雜交目標序列和生物信息學分析

全基因組酶切產物經電泳后，長短不一的片段DNA分離，經Southern印跡法轉印至膜上。經標記的高特異探針（6.5kb，覆蓋核糖體16S, 23S, 5S rRNA及其間隔序列和側翼序列）識別并與膜上的特異DNA片段雜交。雜交產物經化學發光后，可在膜上產生位移、顏色不一的高分辨條帶（指紋圖譜），經軟件自動分析，根據帶型和帶數的多態性對細菌進行鑒定和分型。靈活的廣譜性和通用性應用，可方便用戶采用標準化的酶切方法和探針對多種不同的微生物進行分析和比較，高分辨性能確保系統能產生足夠數量條帶的指紋圖譜，且具備較高的分型力和良好的重復性。強大的數據分析能力使數據搜索、分類、報告和追溯等操作更為簡便和靈活，可建立個性化菌株信息庫，實現更廣泛的應用。

傳統表型方法與16S測序方法在菌株的鑒定方面存在局限性，更無法在菌株水平開展分型分析，這主要是因為這兩種方法的微生物分類水平較低，只能鑒定到“屬”或“種”的水平，分辨力有限；容易受到培養條件、環境和培養物本身變異和多態性影響，準確度有限；16S 測序方法通常只檢測 16S rRNA 基因上高度保守的 500 個堿基或整個片段序列，因此基因信息量有限，對于種間差異小（16S 序列接近）的細菌，鑒定效果受到局限，且依賴PCR擴增技術，因此存在容易污染和非特異性擴增問題，從而降低保真性和重現性。

由于這些局限性，使這兩種方法均無法達到“菌株水平”的分辨力，在風險評估、監測和預警上的作用有限。

RiboPrinter® 除了能分析16S序列，還能分析23S，5S及其間隔和側翼50kb范圍內的DNA序列。如果使用個性化探針，還能將分析范圍拓展到全基因組水平，能進行高平行性的全基因組分子水平上的指紋分析，使鑒定和分型的分辨率達到“菌株”水平，區分相似菌株的細微差別。通過特異性酶切和探針設計的組合應用，還可實現更高分辨力和滿足更廣泛應用的需求！

簡便，卻不簡單

多種菌株分析應用，盡在一種全自動化方案！RiboPrinter® 系統的操作非常簡便，手工操作僅一步，剩下的繁瑣步驟均由系統全自動完成。但簡便并不意味著功能的減少，相反，RiboPrinter® 系統可為您呈現更多有價值的信息：

·菌株種屬鑒定和高分辨分子分型，可提供菌株的基本信息，鑒別相似菌株之間的細微差別，適用于流行病學研究，微生物風險評估、監測和污染溯源，特殊菌株的篩選和驗證

·高分辨的指紋條帶兼具保守性（如屬特異條帶和16S rDNA保守條帶等）和多態性（如核糖體編碼基因上下游區域及間隔區內的堿基突變所形成的條帶）。研究發現，緊連核糖體基因的上下游區域在進化中多處于中性，這些管家基因（Housekeeping gene）常常是多位點序列分型（MLST）的分析位點，這使RiboPrinter® 系統可用于分離株之間進化遺傳相關性特征的分型分析，適用于系統發育、 種群生物學、微生態學、微生物分類學、微生物生理學、遺傳學和分子生物學等研究

開放應用平臺，滿足高分辨個性化研究需求

RiboPrinter® 系統的標準化酶切和探針雜交方案在速度和分型力等參數之間進行了優化與平衡，在滿足高分辨力的同時大幅提升了檢測速度，可滿足大多數應用需求，有效縮短了等待時間。作為一個開放平臺， RiboPrinter® 系統也為用戶提供了進一步提升分型力和多元化應用的可能。用戶有多種優化的方法提升系統的分型能力，或拓展更廣泛的應用。

如，用戶可選擇更特異的限制性酶切方案，選擇在16S, 23S或5S序列中有酶切位點的限制性內切酶，這樣就可使圖譜的條帶數翻倍。

或，采用混合酶切方案，即同時使用或按順序使用2種或2種以上的限制性內切酶，達到理想的分型效果。

還可，選擇管家基因或其他任何您所感興趣的分子探針。研究表明，在菌株基因組內核糖體操縱子上下游片段中存在非常保守的管家基因，針對這些特異序列設計探針，可大大增加指紋圖譜的分型力。用戶甚至可針對基因組內其他兼具保守性和多態性的位點設計探針，滿足個性化研究的需求！

強大而靈活的交互式聯網平臺

RiboPrinter® 系統強大的聯網應用和數據架構非常適合快速構建網絡化應用平臺，兼容的電子數據可方便的管理和導入第三方分析軟件：

·獨特的“一對一”，“一對多”和“多對一”數據系統架構，助您快速構建監測網絡和應用平臺

·無需樣品轉移，所有檢測均可在就近的網絡實驗室進行，標準化的數據可通過自動或手動的方式傳輸到中心服務器

·中心服務器負責所有信息的處理及保存，也可完成遠程終端的數據處理要求

·來自各個網絡實驗室的數據可在中心服務器進行匯總比對，進一步優化算法，形成更大的、更可靠的菌株信息庫

·標準化的數據可方便地共享、管理或對接第三方分析軟件（如BioNumerics）

支持多賬戶創建和密碼保護，支持設備的遠程訪問、操作和診斷，即使身處辦公室亦可實時分析、監控狀態和進展

高性能系統，靈活應用多面手

食品、制藥、個人護理用品生產質控和質保

·RiboPrinter® 系統可快速、準確、高分辨地鑒定和分型產品或環境中的分離到的微生物并追溯源頭，幫助管控微生物污染風險，完全滿足法規要求，提升品牌價值

·高通量，流程時間優化，全自動操作和數據分析等特點可縮短產品放行時間，減少庫存，并降低對實驗員資質和培訓的依賴

·高準確度和分辨力有助于風險監測，建立評估、干預等措施

疾病網絡化監測與風險評估

·RiboPrinter® 系統可高準確、高分辨地分析各種食品和環境樣品中分離的已知或未知致病菌，明確其相關性，標準化和個性化的試劑盒及流程可滿足網絡化監測和風險評估的需求

·快速、高通量、標準化和全自動的流程可有效提升實驗員的工作效率，并減少人間差異和交叉污染對監測和評估的影響

·通過世界權威機構的驗證，更有公信力的菌株數據信息

食物中毒調查及疾病預防和控制

·RiboPrinter® 系統可在最短時間內大規模篩查可疑樣品，明確污染源和傳染關系，并阻斷其傳播途徑

·高準確、高分辨和廣譜性能有助于分析并確認可疑菌株，尤其對于表型法難檢或未知菌株有較好的鑒定和分型能力

·通過權威驗證的數據，尤其適用于暴發時的應急檢測和快速反應，可靠性有保障

院內感染調查和干預

·RiboPrinter® 系統可快速、準確、高分辨地病人和醫院環境樣品中的危險致病菌及其相關性，找出導致院內感染的關鍵環節，建立實時監控和高效干預體系

·廣譜分析能力有助于在復雜的微生物環境中發現潛在或未知危險，從而從源頭降低院內感染風險

·全自動分析和高效流程可減少實驗員的負擔及對其資質的要求

功能菌株篩選，研發及微生物相關學科基礎研究

·RiboPrinter® 系統先進的檢測原理和方法學優化能廣泛地滿足各個領域微生物研究的需求，更能為個性化研究提供平臺和解決方案顯著提升研究效率

·全自動流程和分析，無需核酸提取和純化，能有效避免主觀因素，減少人為干擾和交叉污染風險，獲得高穩定性和重現性結果